В 2009 году в школе создано первое в Санкт-Петербурге структурное подразделение «Центр Информатизации Образования» (ЦИО) с целью организации системы дистанционного обучения детей-инвалидов и детей с ограниченными возможностями здоровья. ЦИО обеспечивает консультирование и обучение родителей учащихся, получающих образование в дистанционной форме, техническую поддержку образовательного процесса, создание информационных ресурсов в виде курсов дистанционного обучения, подбор сетевых источников (специализированных сайтов и порталов), соответствующих образовательным возможностям и потребностям обучающихся. За счёт средств бюджета в ГБОУ СОШ №6 приобретен программно-аппаратный комплекс «ПЕЛИКАН», предназначенный для работы учителя с детьми, которые не могут находиться на уроке по состоянию здоровья. Программно-аппаратный комплекс позволяет ученику, имея только ноутбук (стационарный компьютер), гарнитуру и интернет-канал (не больше, чем для youtube) присутствовать на традиционном занятии дистанционно. При ЦИО образовался и активно развивается коллектив специалистов в области дистанционного образования и коммуникаций.