Параллельно с началом строительства к сентябрю 1900 г. Комиссией по подготовке программ и учебных планов были подготовлены проект положения об институте, программы и учебные планы. После обсуждения в заинтересованных ведомствах и учреждениях и рассмотрения поступивших отзывов в Министерстве финансов новый проект положения и штаты были представлены на рассмотрение в Госсовет.
В конце ноября 1901 г. распоряжением министра финансов создается временный орган по управлению институтом — Совещание директоров и деканов С.-Петербургского политехнического института, которое выполняло функции будущих основных руководящих органов СПбПИ: Правления, Совета института и Собраний отделений. Среди вопросов, обсуждаемых на заседаниях Совещания, были вопросы организации учебного процесса, кандидатуры предполагаемых профессоров, преподавателей и лаборантов, подготовка учебно-вспомогательных учреждений, осмотры новых лабораторий и т. п. Кроме того, на Совещании были разработаны правила о профессорском суде, был принят Устав общежития.
4 февраля 1902 г. законопроект об учреждении Петербургского политехнического института был окончательно рассмотрен Государственным советом, и 2 мая 1902 г. положение и штат "высочайше утверждены" Николаем II.
В институте были созданы четыре отделения: экономическое, кораблестроительное, электромеханическое, металлургическое, первыми деканами которых соответственно стали: А.С. Посников, К.П. Боклевский, М.А. Шателен, Н.А. Меншуткин. Особое положение занимал В.В. Скобельцын — профессор, заведовавший студентами. Все без исключения профессора входили по дореволюционному Уставу в состав Совета института, председателем которого был директор.
