Учебные заведения высшего и среднего профессионального образования — основной источник молодых талантливых кадров, поэтому в рамках формирования внешнего кадрового резерва Предприятие активно взаимодействует с профильными учебными заведениями высшего и среднего профессионального образования Санкт-Петербурга.
В настоящее момент действуют 26 соглашений о сотрудничестве.
В 2018 году запущен проект «Лучшая студенческая учебно-исследовательская работа». Ежегодно ГУП «Водоканал Санкт-Петербурга» направляет в профильные учебные заведения темы курсовых и квалификационных работ по актуальным направлениям деятельности Предприятия.